Сергей Ефимович родился 29 августа 1927 года в селе Николо — Пёстровка Пензенской области.
Окончил Уральский политехнический институт по специальности «обработка металлов давлением».
Свою трудовую деятельность начал на Северском трубном заводе.
Сергей Ефимович Ананьев руководил городом на протяжении 20 лет, с 1965 по 1985 год; с 1965 по 1972 – председатель исполкома горсовета народных депутатов, с 1972 по 1985 год – первый секретарь городского комитета КПСС. Сергей Ананьев стал инициатором создания генерального плана развития города, введя должность главного архитектора. Он первый, кто наладил прочные отношения с руководителями промышленных предприятий и с их помощью строил детские сады, школы, жилые дома, был возведён больничный городок в южной части города. Сергей Ефимович умел подбирать людей с деловой хваткой, помогал им становиться руководителями, вырастив таким образом целую плеяду запоминающихся фамилий. Его работоспособность поражала, его авторитет был непререкаем, на него равнялись. Он без труда находил общий язык и с рядовыми людьми, и с союзными министрами и директорами крупных предприятий.
В 1986 году Сергей Ананьев вернулся на Северский трубный завод с городской партийной работы. Награжден двумя орденами Трудового Красного Знамени, медалью «За доблестный труд». На основании решения Думы МО «Город Полевской» от 19.03.1998 г. Сергею Ефимовичу было присвоено звание «Почетный гражданин Полевского».
29 августа 2016 года на фасаде одного из домов на улице Некрасова, где жил Сергей Ефимович, была открыта памятная доска